[Windows 7] Gros problème de fichiers systèmes manquants

Bonjour.
Sur mon pc windows 7, j'ai (gros) problème de fichiers systèmes manquants.
C'est en voulant utiliser msconfig que je m'en suis rendu compte: il ne voulait pas se lancer depuis le menu démarrer. J'ai vérifié le regisrte:

HKEY_LOCAL_MACHINE\SOFTWARE\Microsoft\Windows\CurrentVersion\App Paths\MSCONFIG.EXE

n'existe pas. Grace à ce post, je recrée donc la clef. En vain.
Alors, je vais dans son répertoire

C:\WINDOWS\PCHEALTH\HELPCTR\BINARIES

, et c'est là le choc: le dossier PCHEALTH ne contient que le dossier ERRORREP (contenant lui-même deux dossiers, vides). Ou sont passés les autres dossiers? Les fichiers? Est-ce que j'ai d'autres données manquantes? Est-ce que ça va empirer? Comment palier le problème?

Je précise que je venais de faire un checkdisk, et que je nettoie souvent mon pc avec Ccleaner, Adwcleaner, malwarebytes, que mon antivirus (avast free) est à jour et actif.
Je fais beaucoup de choses sur mon pc, ça me dérangerais de réinstaller mon OS et ses 700Go de softwares à retélécharger... (Surtout avec mon débit internet de 100KB/s à peine...)