En fait tu peux monter un système de fichier écrit en ntfs soit en tant que système de fichier ntfs (juste les droits en lecture), soit en ntfs-3g (droits en lecture et écriture).
Pour manipuler ta base je pense qu'il vaut mieux avoir les droits en lecture et en écriture (j'imagine que quand tu manipules une base il mets des verrous sur les fichiers de stockage de la base), et c'est du coup possible avec ntfs-3g. Mais si ça se trouve ntfs suffit.
Bref une fois ta partition montée, il doit être possible de la gérer depuis phpmyadmin sous ubuntu et j'imagine, de l'importer dans une base sur ton système de fichier linux (par exemple le temps de réinstaller windows, puis de l'exporter dans une base de donnée sur ta partition ntfs). En fait ma dernière utilisation de phpmyadmin est assez lointaine, c'est juste une piste que je te donne et j'ignore ce qu'il est aujourd'hui vraiment possible de faire...
Bonne chance
Avantage base donnée sql
