Convertir une vidéo en incrustant des sous-titres

Bonjour,

Je me retrouve face à un soucis, et malgré de multiples bidouillages, je ne m'en sors pas.

J'ai une vidéo en .mkv, avec deux pistes audio et deux pistes sous-titres. J'aimerais la convertir en conservant une piste audio et en incrustant les sous-titres, afin de la compresser (x5 environ).

J'ai eu beau bidouiller avec de multiples logiciels, je ne m'en sors pas. Soit je perds les sous-titres, soit la qualité devient dégueulasse (je me doute qu'il y a aura une perte de qualité, mais en compressant avec Super, j'ai gardé une bonne qualité d'image et de son, mais j'ai perdu les sous-titres, soit je perds l'audio, soit ça me rend un truc complètement anarchique avec des morceaux dans tous les sens).

En bref, quelles sont les étapes à suivre et avec quel logiciel pour arriver à ce que je veux ?

Merci d'avance pour votre aide