Arret maladie et congés payés

Bonjour,
Je vous explique rapidement : avant mon congé maternité, j'ai été en arrêt 16 semaines mais non consécutives, c'est à dire que j'ai eu plusieurs arrêts avec des reprises entre les uns et les autres. A mon retour (soit après mon congé maternité), mon employeur me dit que cet arrêt de 16 semaines me pénalise de 8 jours de congés payés dans le sens ou je n'ai pas "cotisé" pour ces 8 jours vu que je ne travaillais pas.
Merci de prendre le temps de me répondre.
Jenn