En téléchargeant des données sur Internet, il est possible que les données soient altérées par un tiers ou tout simplement que le lien de téléchargement soit corrompu. MD5 Checksum est un outil permettant de vérifier l'intégrité d'un fichier par la somme MD5. La somme de contrôle du fichier intègre doit être fournie par l'expéditeur ou le site proposant le téléchargement afin que le receveur puisse vérifier le résultat. MD5 Checksum propose un lancement automatique au chargement de Windows avec fenêtre réduite, ou une icône dans la zone de notification pour un accès rapide. Le programme supporte également le glisser/déposer d'un fichier directement sur la fenêtre du programme. Un menu contextuel dans l'explorateur permet de calculer directement la somme MD5 d’un fichier.
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