Problème : Vidéo .avi ne sont plus lisible

Bonjour,
depuis hier j'ai un soucis avec certain de mes fichiers .avi que je stock sur mon disque dur externe (formaté en NTFS). Avant tous les fichiers étaient lisibles et aujourd'hui certain bizarrement, ne le sont plus.
C'est arrivé depuis qu'un ami m'ai passé sont disque dur (formaté en FAT32) pour que je lui passe quelques films. Je prend donc certain de ces film et je lui passe les miens.

Le transfert est normal (fait avec Supercopier2).

Une fois chez lui, il se rend compte qu'une grosse partie des films ne sont pas lisibles. De mon coté certains fichiers que je possédais déjà (les films que je lui ai pris n'ont pas de problèmes) deviennent illisibles.
Pire encore, j'ai l'impression que lorsque je reboot d'autre fichier sont affectés. Je suis certain qu'il ne s'agit pas d'un virus, mais je ne vois pas d'ou ça peut venir.

A la limite j'aimerai bien pouvoir réparer les fichiers emdomagés, existe t il un logiciel pour réparé les .avi ?

Merci de votre aide.