Fichiers système altérés

Avec SFC, j'ai actionné le Vérificateur des Fichiers Système à la recherche d'erreurs. Il m'est proposé de restaurer le fichier. J'ai choisi cette option. On me réclame le CD d'installation. N'ayant que celui de W.98, j'ai donc mis celui-ci dans le lecteur. Un message m'indique que le fichier n'a pas été trouvé.
Ma version de W.98 est une mise à jour, s'ajoutant à W.95. Comment faire pour réparer ces fichiers ?
Possédant un deuxième OS (XP.Pro) sur un second disque dur, je n'ose pas réinstaller le W.98 de crainte que plus rien ne fonctionne. A vous qui avez certainement une idée sur la question, je viens demander votre aide et je vous remercie. Bonsoir !