Formater une clé usb en Ntfs sous Linux

Il m'arrive d'avoir des fichiers que je mets sur une clé usb. Je colle le contenu dans un dossier existant dans mon ordinateur, sous Ubuntu, et un jour, Dieu seul sait pourquoi, mon dossier semble corrompu?
Je dois reconnaître que certains fichiers importés par la clé, contiennent des photos retravaillées par mon mari sous Mac !
On m'a dit qu'il fallait que je formate toutes nos clés en NTFS pour ne plus avoir ce genre de désagrément.
Merci de vouloir bien m'éclairer.
poupettebukavu