Formater deux partitions windows + linux

Bonjour,
Je vous présente la situation. J'ai un ordinateur portable avec deux partitions. A vrai dire, trois, car il y en a une qui est tout petite. Une avec Windows, et une autre toute petite qui sert à la restauration de mes fichiers en cas de crash. Une troisième avec Linux que j'ai installé en virtual dub pour essayer.
J'aimerais formater tout ça, Linux, Windows, et réinstaller proprement Windows Vista car j'ai quelques soucis récurrents qui commencent à m'énerver sous Windows.
J'ai un DVD de Vista qui était fourni avec mon ordinateur, mais je n'ai pas osé le mettre dans mon ordinateur, je préfère me renseigner avant!

Est-ce que j'ai des procédures particulières à faire pour formater et réinstaller, ou est-ce que le dvd de Vista me proposera de tout installer par dessus les partitions que je ne veux plus ?

Merci d'avance,
Niouki