Les calques ça sert à empiler des images les unes sur les autres. aussi dans le panneau Calque, il peut y avoir plusieurs calques différents : le calque le plus au dessus est au-dessus de tous les autres, l'image résultante correspond à l'image que t'aurais si tu regardais tous les calques d'en haut, certains cachant d'autres éventuellement.
pour plus de clarté, regarde peut-etre cette vidéo tutoriel :
http://blog.video2brain.com/...
c'est pas exactement la définition des calques qui y est traitée, mais au moins tu verras comment on peut s'en servir.