La marge se calcule sur le Chiffre d'Affaire qui grosso modo est la somme de tes prix de vente.
Tous tes principaux indicateurs de gestion fournis par ton comptable ou ton financier, sont calculés sur ce Chiffre d'Affaire".

Par exemple si ton étude de prix (Fournitures + Main d'oeuvre + équipement de 'l'entreprise + Energie + Sous-traitant + transport...) abouti à un "déboursé sec" = "Prix de revient"
Par exemple de 100 €.

et que tu mets dans ta marge :
Assurances = par exemple 1,75% du chiffre d'affaire
Frais spéciaux = par exemple 2,25% du C.A.
Frais généraux = par exemple 8% du C.A.
Aléas = par exemple 1% du C.A.
Risques et bénéfices = par exemple 22%.
La somme de ces % faisant 35% du C.A. ou autrement dit ; Marge = 35% de ton Prix de vente.

Tu calcules ton Prix de Vente comme étant : Prix de revient / (1-marge)
= 100 € / (1 - 35%) = 100 € / 0,65 = 153,85 €.

Prix de revient / 0,65 = Prix de vente = C.A. de cette affaire ou de ce marché.
La marge étant bien Prix de vente - "Déboursé sec" = 35% du prix de vente.
PV 153,85 € - 100 € = 53,85 € qui est bien 53,85/153,85 = 0,35 = 35%

On vérifie encore par exemple que tes frais généraux font 0,08 x 153,85 = 12,31 €
De même ton poste Assurances : 0,0175 x 153,85 = 2,69 € etc ...