Trouvé !
Le code :

- côté client
public static void sendFile(String pathname,String serv) throws Exception
{
File f = new File(pathname);
if(f.exists())
{
System.out.println("Envoi du fichier "+f.toURI().toURL());
Socket s = new Socket(InetAddress.getByName(serv),port);

OutputStream fluxsortie = s.getOutputStream();

long taillefichier =f.length();

System.out.println("Taille : "+ taillefichier);

long nbpassagesuposé=taillefichier / 4096;

System.out.println("Passages supposés : "+nbpassagesuposé);

InputStream in = new BufferedInputStream(new FileInputStream(f));
ByteArrayOutputStream tableaubytes = new ByteArrayOutputStream();
BufferedOutputStream tampon = new BufferedOutputStream(tableaubytes);

int lu = in.read();
int[] aecrire = new int[4096];
int compteur = 0;
long ouonestrendu=0;

//Tant qu'on est pas à la fin fu chier
while(lu > -1)
{
//On lit les données du fichier
aecrire[compteur] = lu;
lu = in.read();
compteur++;


//Quand on a rempli le tableau, on envoie un paquet de 4096 octets
if(compteur == 4096)
{
compteur=0;
ouonestrendu++;
//On remplit le tampon
for(int x=0;x<4096;x++)
tampon.write(aecrire[x]);

//Et on l'envoie
fluxsortie.write(tableaubytes.toByteArray());

tableaubytes.reset();
System.out.println("Avancement : "+(float) ouonestrendu/nbpassagesuposé * 100+"%");
}
}

//On envoie le dernier paquet, qui ne fait pas forcément 4096 octets
//On remplit le tampon
for(int x=0;x<4096;x++)
tampon.write(aecrire[x]);

//Et on l'envoie
tampon.flush();
fluxsortie.write(tableaubytes.toByteArray());
fluxsortie.flush();

System.out.println("Avancement: "+(float) ouonestrendu/nbpassagesuposé * 100+"%");

System.out.println("Youpi finished");
in.close();
tampon.close();
System.out.println("Passages effectués : "+ouonestrendu);
s.close();
}
else
{
System.out.println("Le fichier "+f+" est introuvable");
}

}



- serveur :

while(continuer)
{
//On attend la connexion d'un client
Socket serviceSocket = serveur.accept();

Byte[] taillefichier;
int lu;
long taille = 0;

//Création de l'entrée
InputStream inpute = serviceSocket.getInputStream();

OutputStream out = new FileOutputStream("D:\\lol.ha");

//Reçoit du client
BufferedInputStream inBuffer = new BufferedInputStream(inpute);

//Envoi vers le fichier
BufferedOutputStream outBuffer = new BufferedOutputStream(out);

lu = inBuffer.read();

int compteur = 0;

while(lu > -1)
{
outBuffer.write(lu);
lu = inBuffer.read();

compteur++;
}

outBuffer.write(lu);

outBuffer.flush();
outBuffer.close();
inBuffer.close();

out.flush();
out.close();
inpute.close();
serviceSocket.close();

}