1) Une partition étendue n'est pas bootable
2) Tu risques rien... si ce n'est de ne pas pouvoir créer de lecteurs logiques puisque c'est propre aux partitions étendues.
3) Rien a voir ! La fragmentation vient du type de Systeme de Fichier que tu choisis (FAT32, NTFS, ext3...) et aussi de la facon dont tu destines la partition.. si c'est pour faire du SWAP.. forcément ca va faire que ecrire par dessus en vrac.. donc fragmentation un max.. si c'est pour lire une base de données genre stockage de ta videotheque, alors y aura pas de fragmentation.