Le principe est le suivant :
Si tu sais parfaitement ce que tu fais, et que tu sais que c'est nécessaire, tu passes en root pour faire les manipulations sur les fichiers systèmes.
Si tu as un doute, c'est qu'il faut y reréfléchir :-P
C'est pour ça que les systèmes UNIX ont autant de restrictions sur les droits, et c'est là une différence fondamentale avec windows : le systeme fait ce que tu veux qu'il fasse. si tu veux vraiment effacer un fichier systeme, il suffit de dire "oui je sais ce que je fais" (ce qui revient à se logger en root (ou superutilisateur en francais)).
Dans windows c'est différent. Tu as accès à tout, mais tu ne peux pas le modifier, ou tu es redirigé, aidé, on te fait faire autre chose à le place, etc etc. tu es tout a la fois tout le temps en "root" sans jamais l'être vraiment.
Configuration: Linux Fedora
Firefox 2.0.0.5