error while loading shared libraries: libpapi.so.5.4.3.0Résolu/Fermé

Question

Bonjour, 

Je viens ici car vraiment cette erreur me rend complètement dingue.

je compile un programme avec scalasca, et à l'analyse de l’exécutable il me dit qu'il ne trouve pas cette foutue libpapi.

"./a.out: error while loading shared libraries: libpapi.so.5.4.3.0: cannot open shared object file: No such file or directory"

bien surs elle est bien installée sur ma machine, et se trouve bien dans mon $LD_LIBRARY_PATH

quand je fais un ldd sur mon exécutable, je confirme qu'il ne trouve pas : 

$ ldd a.out linux-vdso.so.1 (0x00007ffc91181000) libcube4w.so.7 => /opt/scorep/lib/libcube4w.so.7 (0x00007fc423885000) libcubewriter4.so.7 => /opt/scorep/lib/libcubewriter4.so.7 (0x00007fc423681000) libz.so.1 => /lib64/libz.so.1 (0x00007fc423423000) libdl.so.2 => /lib64/libdl.so.2 (0x00007fc42321f000) libpapi.so.5.4.3.0 => not found libstdc++.so.6 => /lib64/libstdc++.so.6 (0x00007fc422e9c000) libm.so.6 => /lib64/libm.so.6 (0x00007fc422b9a000) libgcc_s.so.1 => /lib64/libgcc_s.so.1 (0x00007fc422982000) libc.so.6 => /lib64/libc.so.6 (0x00007fc4225c1000) /lib64/ld-linux-x86-64.so.2 (0x000055918a7cc000)

$ locate  libpapi.so.5.4.3.0/usr/local/lib/libpapi.so.5.4.3.0

$ echo $LD_LIBRARY_PATH/usr/local/lib64/:/usr/lib:/usr/local/lib/:/home/ilasri/soft/cube/cube-4.3.3/lib:/home/ilasri/soft/scalasca/scalasca-2.2.2/lib:/home/ilasri/soft/scorep/scorep-1.4.2/lib:/home/ilasri/soft/uuid/lib:/home/ilasri/soft/openmpi/openmpi-2.0.2/lib


$ file /usr/local/lib/libpapi.so.5.4.3.0/usr/local/lib/libpapi.so.5.4.3.0: ELF 64-bit LSB shared object, x86-64, version 1 (SYSV), dynamically linked, BuildID[sha1]=1519b2cccf28ca21b690d129c5f33987c8db3c7a, not stripped

je ne sais pas quoi faire d'autre à part exploser mon ordinateur ou changer de métier (que la paix et l'amour soient avec moi)

Merci à toute personne qui peut me venir en aide ! 

bonne journée

Configuration: Linux / Firefox 50.0

mamiemando · Answer

Bonjour,

Ma réponse sera en deux temps (comment on procède pour faire les choses proprement, et ensuite, comment rattraper ton installation). À toi de voir si tu essayes de réparer ou de repartir sur une installation propre.

A) La manière propre

La manière propre de résoudre un problème de librairie non trouvée sous linux consiste à

1) ... vérifier s'il existe un paquet qui fournit la librairie manquante.

- Pour les distributions basées sur apt (debian, ubuntu, ...), cela se fait avec apt-file.
- Apparemment pour les distributions basées sur rpm (fedora, redhat...), cela se fait avec rpm -qa (voir ce site)

Exemple : (sous debian, car je n'ai pas de distribution basée sur rpm sous la main) :

(mando@aldur) (~) $ apt-file search libpapi.solibpapi-dev: /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libpapi.solibpapi5: /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libpapi.so.5libpapi5: /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libpapi.so.5.5.1.0

Ici on voit que le paquet s'appelle libpapi5.

Note : je suppose que dans ton cas ce serait rpm -qa | grep libpapi

2) ... installer le paquet s'il existe

Si un tel paquet existe, l'installer suffira à résoudre le problème. Pour une distribution basée sur apt, ce serait typiquement la commande apt-get. Sous fedora, j'imagine que c'est yum ou dnf qui sera utilisé.

Exemple : (sous debian, car je n'ai pas de distribution basée sur rpm sous la main) : en root :

apt-get updateapt-get install libpapi5

Note : dans ton cas j'imagine que ce serait quelque chose du genre yum update et yum install libpapi5.

3) ... et sinon installer la librairie autrement

Il faut chercher le site officiel du projet qui fournit soit des sources à compiler et à installer (i.e. un dépôt git), soit des archives prêtes à l'emploi.

Il semble que dans le cas présent, les sources soient disponibles sur git. Même si installer ainsi ta librairie est faisable, l'installation est plus fastidieuse et moins propre, donc je t'invite à privilégier l'installation par paquet (i.e. via yum).

B) Dans ton cas

Tu as choisi l'option (3) apparemment. Mais la librairie n'est pas trouvée, probablement parce que tu n'as pas lancé ldconfig après l'avoir installé.

Bonne chance

hymenoptera · Answer

Merci pour ta réponse, 

justement comme tu l'as bien dit, j'ai installé papi en compilant le code source.

mais bon... j'ai suivi quand même ce que tu as dit avec rpm :

 $ rpm -qa | grep papipapi-libs-5.4.1-3.fc23.x86_64papi-5.4.1-3.fc23.x86_64

$sudo dnf install papi-libs-5.4.1-3.fc23.x86_64Vérification de l'expiration des métadonnées effectuée il y a 1:58:38 sur Thu Oct 26 11:47:46 2017.Le paquet papi-libs-5.4.1-3.fc23.x86_64 est déjà installé, ignorerDépendances résolues.Rien à faire.Terminé !$ sudo dnf install papi-5.4.1-3.fc23.x86_64Vérification de l'expiration des métadonnées effectuée il y a 1:58:46 sur Thu Oct 26 11:47:46 2017.Le paquet papi-5.4.1-3.fc23.x86_64 est déjà installé, ignorerDépendances résolues.Rien à faire.Terminé !


je relance mon excécutable : 

./a.out: error while loading shared libraries: libpapi.so.5.4.3.0: cannot open shared object file: No such file or directory


O_O AAAAHHHHHHHHHHH :'( :'(

dubcek · Answer

hello
comme suggéré précedemment, essayer
sudo ldconfig -v

mamiemando · Answer

Quelle librairie n'est pas trouvée (peux-tu reporter le message d'erreur correspondant) ?

As-tu regardé si la librairie (fichier .so) qui n'est pas trouvée était dans un répertoire standard (e.g. /usr/local/lib) ? Si ce n'est pas le cas, tu as peut être juste oublié de faire sudo make install ?

Pour répondre à ta dernière question, tu peux au moment de compiler passer des options de compilation pour compléter la liste de répertoires où chercher des librairies.
https://forums.commentcamarche.net/forum/affich-27031310-compiler-avec-une-librairie-partagee#3

Bonne chance

Error while loading shared libraries: libpapi.so.5.4.3.0

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