Il suffit de créer la figure à l'aide de la commande figure et de créer des noms de variables pointant vers soit l'objet soit les axes. Démonstration :
figure
figo = gco;
figa = gca;
Ce code doit apparaitre dans le callback du bouton de tracé. Il suffit ensuite que dans la suite du code vous fassiez référence à la bonne variable pour modifier les paramètres. Exemple :
set(figa,'XLimMode','Manual','XLim',[get(handles.xmin,'Value'),get(handles.xmax,'Value')])
Evidemment ce n'est qu'un exemple... Il ne vous reste plus qu'à adapter la modification des propriétés en fonction de votre application...