Il faut paramétrer ton routeur, faire du port forwarding pour rediriger les ports correspondants aux services que tu veux pouvoir utiliser depuis internet. Faudra mettre ton serveur en IP fixe sur ton réseau pour pouvoir rediriger les ports vers cette IP...
Si tu veux un accès complet à ton serveur, le mieux, selon moi est de mettre un VPN en place, bien sécurisé pour que personne d'autre n'ait accès au serveur.
Win2003srv a une fonction de serveur VPN PPTP ou VPN L2TP/Ipsec integré, tu peux essayer de mettre ça en place. Seulement vérifies que ton routeur soit VPN Passthrough, càd qu'il laisse bien passer le traffic VPN, sinon ça ira pas...
Maintenant ton routeur lui-même a peut-être une fonction serveur VPN (j'ai vu que les nouveaux routeurs entrée de gamme vendus maintenant ont souvent ces fonctions, j'ai été étonné...)