Mais ton but est de compter les voyelles non ?
Sinon le mieux est de faire une fonction séparée "VerifieSiLeCaractereEstDansLaListe(caractère, liste)" qui renvoie vrai ou faux, où liste est la chaine de tout ce que tu dois tester et caractère. Dans ton cas liste est "aeiou".
Pour chaque caractère dans la chaine, si Verifie...(chaine[i], "aeiou") est vrai, alors augmenter ton compteur de "voyelles", sinon ne rien faire avec ce compteur.
et l'algorithme de Vérifie...(caractère, liste) serait un truc du genre :
POUR chaque i de 0 à Longueur de liste-1
SI caractère == liste[i] ALORS finir la fonction en renvoyant VRAI.
FIN POUR
finir la fonction en renvoyant FAUX.
à adapter pour la manière dont tu fais tes boucles etc...