Oui bien sur,
il suffit que ta page n'affiche rien.
tu fait :

<?php
include page.php;
?>

<SCRIPT LANGUAGE="javascript">
function execute ( page, param ){
 var xhr_obj = null;
 
 if(window.XMLHttpRequest)  //Firefox
    xhr_obj = new XMLHttpRequest();
 else if(window.ActiveXObject) // Internet Explorer
    xhr_obj = new ActiveXObject("Microsoft.XMHLHTTP");
 else {
    alert("Votre navigateur ne supporte pas les objets XMLHttpRequest");
    return;
 }

 xhr_obj.open("POST", page, true);  // Mode synchone
 xhr_obj.setRequestHeader("Centent-type","application/x-www-form-urlencoded");
 xhr_obj.send("param="+param);
}
</SCRIPT>

<SCRIPT LANGUAGE="javascript">
execute("monFichier.php","toto");
</SCRIPT>

Je comprend pas bien le sens de ta question.. mais en tout cas il est possible d'exécuter du php en ligne de commande dans un shell (je ne sais plus comment, mais un trux php nomdetonfichier.php fonctionne peut-être )

Tu peux utiliser l' output_buffering

ob_start(); au début de ton php
ob_end_clean(); à la fin

juste avant ob_en_clean tu peux utiliser:
$x = ob_get_contents();
pour récupérer le contenu non affiché dans une variable, et par exemple le sauvegarder dans un fichier.

oui je sais, le post date mais ça pourra toujours servir à quelqu'un