Je n'ai pas la reponse sous la main mais je sais qu'il y a plein de choses qu'on peut configurer dans le fichier: /etc/ftpaccess sur le serveur.
Tapes: "man ftpaccess" pour avoir quelques infos la dessus.
Il me parrait plausible que ce soit possible avec ce fichier.
Apart ca tu peux aussi restreindre la lecture de fichiers au niveau des permissions d'utilisateurs. Par exemple le daemon ftp tourne normalement en tant que utilisateur "ftp" (ou similaire) et il ne peut pas lire de fichiers d'un autre utilisateur si les permissions de lecture sur ces fichiers ne sont pas accordes au groupe ou aux autres utilisateurs:
Par exemple si les permission sont comme ici (avec "ls -l"):
-rw------- 1 toto users ...
un autre utilisateur et notamment le ftp ne peuvent pas lire ce fichier.
Pour enlever toutes persmissions pour les autres tu peux faire:
chmod og-rxw fichier
.