Salut,
Pour répondre à ta question : non, il n'existe aucun script en PHP.
Si tu veux vraiment convertir la vidéo avec le serveur, tu devra prendre un hébergement dédié ou un serveur virtuel : moins chère et c'est ce que je te recommande (mais tu peux aussi avoir un vrai dédié pas cher chez kimsufi.com). Une fois que tu as ton dédié (sur Linux de préfèrence), tu devra installer un logiciel : FFMpeg. Ensuite, il ne te restera qu'à créer un script (soit en PHP, soit en Bash) qui s'occupera de tout.
Il existe une fonction en PHP qui va permettre de faire opération comme en console (l'invite de commande si tu préfère) : exec(). Exemple : <?php $liste = exec("ls /var/www/uploads"); // Pour lister le contenu du dossier /var/...)
Pour le moment, ça peut te paraître flou donc je te conseil ce tuto avant de te lancer dans Linux.
Sans Windows, il n'y aurait pas besoin d'informaticiens :p