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Ce que tu cherches à faire c'est pendant l'exécution de ton script PHP, récupérer la valeur de sortie de ton script javascript et l'utiliser ou alors utiliser la valeur de sortie de ton javascript lors de la prochaine exécution de ton PHP ? Au commencement, nous sommes tous des noobs...

Je suis pas très pro en Javascript mais je ne pense pas que ce que tu veux faire soit possible. Le PHP exécute du code côté serveur et renvoi du code HTML (dont la description de ton javascript) qui sera interprété par le navigateur. Le javascript lui est exécuté par le navigateur. Le seul moyen donc pour que ta valeur de sortie de ton javascript soit prise en compte par ton PHP serait de renvoyer cette valeur au serveur (via un POST par exemple) pour qu'il te re-génère la page, ce qui risque de rendre l'affichage de ta page très lourd.

Avec de l'Ajax je ne peux pas te dire comment ça marche, je n'ai encore jamais utilisé. Au commencement, nous sommes tous des noobs...