Bonjour,
J'ai crée un tutoriel a ce sujet mais par contre il faut que la vidéo soit au format avi :
http://www.commentcamarche.net/faq/sujet 16397 comment integrer des sous titres dans une video
J'espere que cela t'aidera.
Cdlt Si ça semble trop beau pour être vrai, alors ça l'est sans d­oute.

Le format .avi est entrain de mourir, vive le mkv :) j'ai le même problème que jL13500, au pire je cherche un moyen de resynchro des sous-titres avec la video (mkv bien sur). jL si tu trouves qque chose mp moi stp.

La réponse de sykes2477 pour l'incrustation:
"Salut et bienvenue!!
Si tu veux avoir un MKV en sortie, tu ne dois pas incruster, mais muxer tes sous-titres.
C'est quoi la différence? Pour faire simple : Incruster --> .AVI et Muxer --> .MKV.
Bon, c'est un peu plus compliqué que ça, mais c'est ce qui s'applique à ton cas.
Alors, comment faire pour muxer tes sous-titres dans ton mkv?
Avant toute chose, tu dois avoir installé les outils Matroska (à télécharger sur la même page ou tu as téléchargé RI4M).
Ensuite, sur la fenêtre principale de RI4M, clique sur Muxer/Demuxer (à droite!! Si tu ne vois pas ce bouton, clique sur outils à gauche, sinon, ça va!!! ).
Maintenant, sur la nouvelle fenêtre, clique sur MMG (en haut à droite toujours).
Et là tu as une toute autre fenêtre qui s'ouvre.
Clique sur "add" (Devine ou? en haut à droite!!), tu choisis ton MKV, ensuite "add", tu choisis ton/tes .srt.
Tout en bas, tu montres le chemin ou tu aimerais avoir ton nouveau MKV, si tu n'y touches pas, il sera dans le même dossier ou se trouve le MKV d'origine.

Clique sur "start muxing" tout en bas (pour changer).
Et patiente quelque minutes.

Voila!!! "
Sinon pour ajuster ou resynchro les sub je te conselle Time Adjuster leger simple et facile et comme lecteur BS player ou il suffit de drag and paste le fichier srt dans la fenetre du film et les sub apparaissent direct il te permet aussi de decaler les sub sans modifier le fichier lui meme.