Lancer une application au démarrage

Bonjour, pour des raisons professionnelles, j'ai dû modifier une ligne du system.ini comme si dessous

[boot]
shell=c:\progra~1\cybeus~1\portui~1.exe
rem shell=explorer.exe

de cette manière mon logiciel démarre à la place de l'explorer. Le problème est que je dois faire démarrer un deuxième logiciel en même temps.
Si je le mets dans le menu démarrer démarrage, il ne démarre pas du fait que l'explorer n'est pas lancé... Idem dans la base de registre. C'est la même chose pour tous les logiciels a par pour Mac Afee VirusScan qui arrive tout de même à se lancer malgré que l'explorer ne soit pas lancé. Je ne vois pas par quel miracle
Le logiciel lancé par Mac Afee est une appli Dos dans l'autoexec.bat
C:\PROGRA~1\FICHIE~1\NETWOR~1\VIRUSS~1\40~1.XX\scan.exe C:\
@IF ERRORLEVEL 1 PAUSE

qui je suppose lance cette apli windows après le démarrage, je ne comprends pas comment.
Aidez-moi svp